土壤診斷還應查看土壤表面。該方法是將患病植物的田地與正常植物相鄰的土壤田地進行比較，以確定是否存在差異。如果是鹽堿危害，一般植物病區地塊表面會有較多的鹽分積累或明顯的鹽分偏移，可初步確診。然而，對于土壤養分，植物表現出缺乏某些養分或中毒的癥狀。視覺判斷力不好。癥狀區和正常區的土壤表面沒有區別。

　　診斷不僅包括作物的地上部分和土壤表面，還包括作物地下部分的癥狀和土壤狀況，即從作物和土壤分析病因。一般來說，土壤與作物之間的生理協調關系更為準確。如土壤排水性差，滲透性差，土壤中的有毒物質容易在表面積聚，一般作物的根又小又短。

　　在這種情況下，即使少量新根為白色或棕色，大部分根為黑色或腐爛，整個作物也會顯得脆弱或枯萎。土壤干燥時，根系將水分吸收到深層土壤中，根系分布較深。當土壤表面潮濕時，土壤溫度較低。然而，根系很短，大部分分布在地表。只有輕耕或深耕的土壤和根系分布更均勻。側根較多，表皮光滑，無彎曲變形。由此可見，作物根系的生態變化是對土壤某些特性的客觀響應，也是土壤診斷的一個重要方面。